वैकल्पिक ईंधन के क्षेत्र में, ईआईएल जैव-ईंधन क्षेत्र में प्रवेश कर रहा है क्योंकि वे एक स्थायी ऊर्जा भविष्य के लिए जीवाश्म ईंधन के पूरक के लिए एक आशाजनक विकल्प हैं। कंपनी ने 2जी इथेनॉल प्रौद्योगिकी के लिए केमपोलिस ओए, फिनलैंड के साथ एक रणनीतिक गठबंधन बनाया है और जैव-विमानन टर्बाइन ईंधन (बायो-एटीएफ) का उत्पादन करने के लिए जैव-जेट ईंधन प्रक्रियाओं को विकसित करने के लिए सीएसआईआर-आईआईपी के साथ सहयोग कर रही है।

ईआईएल मैसर्स एबीआरपीएल की असम बायो रिफाइनरी परियोजना को क्रियान्वित कर रहा है, जो ईंधन-ग्रेड इथेनॉल के उत्पादन के लिए बांस आधारित फीडस्टॉक का उपयोग करके भारत में अपनी तरह का पहला संयंत्र है। अग्रणी परियोजना में बांस के 300 टीएमटीपीए को संसाधित करने की क्षमता होगी, जिसे मुख्य रूप से भारत के उत्तर पूर्वी हिस्से से प्राप्त किया जाएगा और फरफ्यूरल, एसिटिक एसिड आदि के रूप में संबद्ध मूल्य वर्धित उत्पादों के साथ 49 टीएमटीपीए इथेनॉल का उत्पादन करेगा। रिफाइनरी में फुरफ्यूरल से फरफ्यूरल अल्कोहल रूपांतरण के लिए इन-हाउस तकनीक के माध्यम से उत्पादों के विविधीकरण की भी गुंजाइश है।